Les deux réserves offrent une grande diversité de milieux : le Massereau avec ses prairies naturelles, son maillage bocager de frênes têtards, ses haies ripisylves, ses étangs, ses roselières, ses remises inondables et le Migron, avec ses prairies inondables et ses roselières.
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ANGÉLIQUE ET FRITILLAIRE
Fleurons de l'Estuaire La diversité des milieux, les gradients d'inondation et de salinité sont à l'origine d'une grande diversité d'espèces végétales. Dans les secteurs les plus inondés dominent Roseau, Phalaris, Scirpes, Carex et Glycérie. Dans les prairies fleurit la Guimauve, parmi de nombreuses graminées. Les haies sont principalement constituées de Frêne. Près de l'écluse des Champs Neufs pousse l'Angélique des estuaires, endémique des estuaires de l'Atlantique, et sur les prairies du bord du Canal éclot la Fritillaire pintade, sorte de tulipe sauvage. Ci-dessous les inventaires botaniques des Réserves du Massereau et du Migron.
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